付款协议的盖章方式如下：
单位公章或合同专用章：
协议的最后落款处需要加盖单位的公章或合同专用章。这是确保协议合法性和有效性的重要步骤。
法定代表人签字：
如果协议中涉及单位法定代表人，则需要在合同的最后尾页法定代表人签字处加盖法定代表人签名章，或者由法定代表人亲自签字。
骑缝章：
如果付款协议有多页，建议加盖骑缝章。骑缝章是将每一页在侧面错开，保证每一页都露出一小部分，面积大小要略大于印章的大小，蘸取少量印油后将印章按压到错开的多页文件侧边上，印油干透后再次展开多页文件的侧边，检查是否有漏盖的页面，如有漏盖应当再次加盖。这样可以确保合同在多页的情况下，每一页都得到有效盖章，防止被替换或篡改。
印章清晰度：
所有印章需清晰，且注意单位印章名称是否与企业名称相对应。这是为了确保印章的真实性和合法性。
本人签字：
签字必须是本人签字，当面签字，防止被别人代签。这是为了确保签字的真实性和有效性。
总结：
在协议的最后落款处加盖单位公章或合同专用章。
如果涉及法定代表人，则需要在法定代表人签字处加盖签名章或由法定代表人亲自签字。
如果协议有多页，建议加盖骑缝章。
确保所有印章清晰，且印章名称与企业名称相对应。
签字必须是本人签字，当面签字，防止代签。
